20世纪90年代初，经过连年政治运动的中华大地正在酝酿新的蜕变，改革开放方兴未艾，普通老百姓的生活即将发生翻天覆地的变化。在北方一个稍显落后的小城市内，由长兄志平（张嘉译 饰）支撑的陈家也在这股洪流中萌动，大妹志芳（李歌 饰）在丈夫赵永明（刘燕军 饰）的撺掇下悄悄踏上南去的列车，去广州追寻他们的发财梦；勤劳优秀的妻子周芸（刘蓓 饰）意外沦为下岗人员，不甘落后的她毅然决定去广东为粮食局开拓窗口，并在连番显示冲击下得到贵人旷大成（范明 饰）的帮助，而她和丈夫的关系也日趋紧张起来。固守老家的志平事业渐有起色，而接二连三前往广东淘金的家人成了他心头最深的牵挂。 物欲横流的时代，人们该如何面对曾经弥足珍贵的亲情、友情与爱情……
这段故事描述了广州姑娘余雯清在西南边陲神秘失踪后，丈夫刘晨旭千里寻妻的经历，以及余雯清与店主林阿发之间的不幸遭遇。刘晨旭心急如焚，千里迢迢来到余雯清失踪的小县城，并投宿于一家小旅馆。这家旅馆的店主是林阿发，一个文革时代留下来的广州知青，因相貌丑陋而备受歧视。然而，林阿发内心充满了对社会的仇恨和自卑感。 余雯清是在前往边境小镇感受异国风情时与林阿发相遇的。尽管林阿发的相貌让她感到不快，但因为同乡之间的相通语言以及陌生环境下的彼此依赖，她最终住进了林阿发经营的小旅馆，并因为吸食了林阿发提供的有毒香烟而上瘾。林阿发利用毒品的诱惑迫使余雯清成为他的情妇，并囚禁在旅馆的阁楼里，滥用她的身体。而林阿发则因为藏匿了五公斤的毒品而备受压力，担心贩毒一事曝光会给自己带来严重的后果，于是决定除掉刘晨旭以消除隐患。
军医大学开学典礼上，一批来自五湖四海的优秀青年男女聚集在一起。将门虎女肖虹（颜丙燕 饰）有一种天生的优越感，开车来报到的黎明（田鹏 饰）受到队长黄大鹏（杨宝光 饰）的训斥，而出身高干家庭的江男（杨圣文 饰）则给人心直口、波澜不惊的感觉。五年的学员生活开始了，要强的肖虹因 嫉妒处处比自己强的司琪（刘威葳 饰），耍小聪明使其受了处分。因一封告状信，司琪失去了出国的机会，赵志伟（罗钢 饰）误为信是肖虹所写，于是当众斥责，肖虹愤然离校。当江男得知自己患血癌吋，内心的强大最终使她从绝望中走了出来，同学们纷纷到医院献血抢救战友。临近毕业，学员们积极筹备野战救护演习，气若游丝的江男告诉肖虹，她也想参加，她想把生命的最后时刻留在演习场上……
《万万没想到 第三季》主打“限量”概念，延续天马行空的喜剧风格，并与大电影深度绑定，共同升级万万经典品牌。导演叫兽易小星带领原班人马，继续为网友奉献最火爆的网络迷你喜剧。剧中王大锤也迎来新的挑战，无论是市井小民还是九五之尊，大锤永远都积极应对，收获人生每一个“万万没想到”的结局。限量的剧集，无限的欢乐，尽在《万万没想到》第三季！
